우리나라의 결핵균 분류에 효과적인 새로운 VNTR (Variable-Number Tandem Repeats) Loci 조합
저자
발행기관
대한결핵 및 호흡기학회(The Korean Academy of Tuberculosis and Respiratory Diseases)
학술지명
권호사항
발행연도
2012
작성언어
Korean
KDC
511
자료형태
학술저널
수록면
275-275(1쪽)
제공처
목적: Beijing 균주에 대한 VNTR loci의 분류 능력은 Beijing genotype이 널리 퍼져있는 나라들마다 다르게 보고되어 왔다. 본 연구를 통하여 이미 알려져 있는 VNTR loci 조합의 균주 변별력을 평가하고 우리나라 결핵 균주에 효과적인 loci를 선별하고자 한다. 방법: 결핵균의 변별력을 평가하기 위하여, 전국에서 수집된 307개의 임상 균주를 대상으로 하여 RFLP와 VNTR typing을 실시하였다. VNTR에 사용된 loci는 Supply-24와 JATA-15에 포함된 loci를 포함하여 32개를 사용하였다. 그리고 allelic diversity(h)와 HGDI를 구하여 VNTR locus의 균주 변별력과 RFLP와 VNTR typing의 균주 분류능을 각각 평가하였다. 성적: VNTR에 사용된 32개 loci 중 h value가 0.6 이상인 12개 loci(MIRU-26, -31, QUB-11a, -11b, -26, Mtub-04, -21, VNTR-3232, -3336, -3820, -4120, -4156)를 확인하였고 이 조합을 KIT-12라고 명명하였다. 새로운 KIT-12와 기존의 Supply-15, Supply-24, JATA-15를 이용한 VNTR 방법과 RFLP의 HGDI는 각각 0.9997, 0.9980, 0.9987, 0.9992, 0.9992로 KIT-12의 분류능이 가장 높았다. 본 연구에 사용된 307개의 균주 중 248개(80.8%)가 Beijing 균주였다. 결론: 새로운 조합인 KIT-12 loci를 이용한 VNTR 분석법은 Beijing 균주의 비중이 높은 우리나라의 결핵균을 효과적으로 분류할 수 있을 것이라 기대한다.
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