KCI우수등재
Analysis of antibiotic resistance genes in pig feces during the weaning transition using whole metagenome shotgun sequencing
저자
Gi Beom Keum (Department of Animal Resources Science, Dankook University) ; Eun Sol Kim (Dankook University) ; Jin Ho Cho (Chungbuk National University) ; 송민호 (충남대학교) ; Kwang Kyo Oh (National Institute of Agricultural Sciences, Rural Development Administration) ; Jae Hyoung Cho (Dankook University) ; 김신아 (단국대학교) ; 김혜리 (단국대학교) ; 곽진옥 (단국대학교(천안캠퍼스) 동물자원과학글로벌연구센터) ; 두현옥 (단국대학교(천안캠퍼스) 동물자원과학글로벌연구센터) ; Sriniwas Pandey (Department of Animal Resources Science, Dankook University) ; 김현범 (단국대학교) ; 이주훈 (서울대학교) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2023
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI우수등재
자료형태
학술저널
수록면
175-182(8쪽)
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제공처
Antibiotics have been used in livestock production for not only treatment but also for increasing the effectiveness of animal feed, aiding animal growth, and preventing infectious diseases at the time when immunity is lowered due to stress. South Korea and the EU are among the countries that have prohibited the use of antibiotics for growth promotion in order to prevent indiscriminate use of antibiotics, as previous studies have shown that it may lead to increase in cases of antibiotic-resistant bacteria. Therefore, this study evaluated the number of antibiotic resistance genes in piglets staging from pre-weaning to weaning. Fecal samples were collected from 8 piglets just prior to weaning (21 d of age) and again one week after weaning (28 d of age). Total DNA was extracted from the 200 mg of feces collected from the 8 piglets. Whole metagenome shotgun sequencing was carried out using the Illumina Hi-Seq 2000 platform and raw sequence data were imported to Metagenomics Rapid Annotation using Subsystem Technology (MG-RAST) pipeline for microbial functional analysis. The results of this study did not show an increase in antibiotic-resistant bacteria although confirmed an increase in antibiotic-resistant genes as the consequence of changes in diet and environment during the experiment.
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