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단백질 이차 구조 예측을 위한 합성곱 신경망의 구조 = Architectures of Convolutional Neural Networks for the Prediction of Protein Secondary Structures
저자
지상문 (경성대학교) ; Chi, Sang-Mun 연구자관계분석
발행기관
학술지명
한국정보통신학회논문지(Journal of the Korea Institute Of Information and Communication Engineering)
권호사항
발행연도
2018
작성언어
Korean
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
728-733(6쪽)
KCI 피인용횟수
2
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단백질을 구성하는 아미노산의 서열 정보만으로 단백질 이차 구조를 예측하기 위하여 심층 학습이 활발히 연구되고 있다. 본 논문에서는 단백질 이차 구조를 예측하기 위하여 다양한 구조의 합성곱 신경망의 성능을 비교하였다. 단백질 이차 구조의 예측에 적합한 신경망의 층의 깊이를 알아내기 위하여 층의 개수에 따른 성능을 조사하였다. 또한 이미지 분류 분야의 많은 방법들이 기반 하는 GoogLeNet과 ResNet의 구조를 적용하였는데, 이러한 방법은 입력 자료에서 다양한 특성을 추출하거나, 깊은 층을 사용하여도 학습과정에서 그래디언트 전달을 원활하게 한다. 합성곱 신경망의 여러 구조를 단백질 자료의 특성에 적합하게 변경하여 성능을 향상시켰다.
더보기Deep learning has been actively studied for predicting protein secondary structure based only on the sequence information of the amino acids constituting the protein. In this paper, we compared the performances of the convolutional neural networks of various structures to predict the protein secondary structure. To investigate the optimal depth of the layer of neural network for the prediction of protein secondary structure, the performance according to the number of layers was investigated. We also applied the structure of GoogLeNet and ResNet which constitute building blocks of many image classification methods. These methods extract various features from input data, and smooth the gradient transmission in the learning process even using the deep layer. These architectures of convolutional neural networks were modified to suit the characteristics of protein data to improve performance.
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2011-11-23 | 학술지명변경 | 외국어명 : THE JOURNAL OF The KOREAN Institute Of Maritime information & Communication Science -> Journal of the Korea Institute Of Information and Communication Engineering | KCI등재 |
2011-11-16 | 학회명변경 | 영문명 : International Journal of Information and Communication Engineering(IJICE) -> The Korea Institute of Information and Communication Engineering | KCI등재 |
2011-11-14 | 학회명변경 | 한글명 : 한국해양정보통신학회 -> 한국정보통신학회영문명 : 미등록 -> International Journal of Information and Communication Engineering(IJICE) | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
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2016 | 0.23 | 0.23 | 0.27 |
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0.24 | 0.22 | 0.424 | 0.11 |
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