KCI등재
SCIE
SCOPUS
Complete Genome Sequencing and Infectious cDNA Clone Construction of Soybean Mosaic Virus Isolated from Shanxi
저자
Defu Wang (Shanxi Agricultural University) ; Liyan Cui (Shanxi Agricultural University) ; Li Zhang (Shanxi Agricultural University) ; Zhennan Ma (Shanxi Agricultural University) ; Yanbing Niu (Shanxi Agricultural University) 연구자관계분석
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발행연도
2021
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-주제어
KDC
524
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KCI등재,SCIE,SCOPUS
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학술저널
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162-172(11쪽)
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Soybean mosaic virus (SMV) is the predominant viral pathogen that affects the yield and quality of soy- bean. The natural host range for SMV is very narrow, and generally limited to Leguminosae. However, we found that SMV can naturally infect Pinellia ternata and Atractylodes macrocephala. In order to clarify the molecular mechanisms underlying the cross- family infection of SMV, we used double-stranded RNA extraction, rapid amplification of cDNA ends polymerase chain reaction and Gibson assembly tech- niques to carry out SMV full-length genome amplifi- cation from susceptible soybeans and constructed an infectious cDNA clone for SMV. The genome of the SMV Shanxi isolate (SMV-SX) consists of 9,587 nt and encodes a polyprotein consisting of 3,067 aa. SMV-SX and SMV-XFQ008 had the highest nucleotide and ami- no acid sequence identities of 97.03% and 98.50%, re- spectively. A phylogenetic tree indicated that SMV-SX and SMV-XFQ018 were clustered together, sharing the closest relationship. We then constructed a pSMV-SX infectious cDNA clone by Gibson assembly technology and used this clone to inoculate soybean and Ailanthus altissima; the symptoms of these hosts were similar to those caused by the virus isolated from natural infected plant tissue. This method of construction not only makes up for the time-consuming and laborious defect of traditional methods used to construct infec- tious cDNA clones, but also avoids the toxicity of the Potyvirus special sequence to Escherichia coli, thus providing a useful cloning strategy for the construction of infectious cDNA clones for other viruses and laying down a foundation for the further investigation of SMV cross-family infection mechanisms.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2010-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2000-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.14 | 0.32 | 0.84 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.69 | 0.57 | 0.477 | 0.17 |
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