KCI등재
SCOPUS
SCIE
Functional analysis of a cryptic promoter from Arabidopsis thaliana reveals bidirectionality
저자
Sujatha. T. Parvathy (Indian Agricultural Research Institute) ; R. Srinivasan (Indian Agricultural Research Institute) 연구자관계분석
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학술지명
권호사항
발행연도
2016
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
241-255(15쪽)
KCI 피인용횟수
1
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Cryptic promoter elements play a significant role in evolution of plant gene expression patterns and are prospective tools for creating gene expression systems in plants. In a previous report, a 452 bp promoter fragment designated as cryptic root-specific promoter (AY601849) was identified immediately upstream to T-DNA insertion, in the intergenic region between divergent genes SAHH1 and SHMT4, in T-DNA tagged mutant M57 of Arabidopsis thaliana. In silico analysis of 452 bp promoter revealed typical eukaryotic promoter architecture, presence of rootspecific motifs and other cis-regulatory motifs responsible for the spatial and temporal expression. GUS expression driven by 452 bp in M57 was developmentally as well as light-regulated. The AT-rich 452 bp promoter does not show homology to any known sequences. The 452 bp promoter was further proved cryptic and detailed molecular characterization of the promoter carried out through serial 50 and 30 deletion analysis, by cloning the promoter fragments upstream to promoter-less GUS vector. A 279 bp fragment obtained by deleting 173 bp from 50 end of 452 bp was capable of driving root-specific expression, similar to that of full-length promoter. Further, root tipspecific, root-specific and core-regulatory motifs for rootspecific expression were identified at positions 173–227, 251–323 and 408–452 bp, respectively, from the 50 end of 452 bp. The 452 bp promoter was equally functional in inverse orientation, hence bidirectional and symmetric. In heterologous systems, such as Brassica juncea and Oryza sativa, the promoter activity was not significant since GUS was not visually detected in transient assays.
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-01-01 | 평가 | SCIE 등재 (신규평가) | KCI후보 |
2005-10-31 | 학회명변경 | 영문명 : Korea Society Of Plant Biotechnology -> Korean Society for Plant Biotechnology |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.42 | 0.21 | 0.88 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.71 | 0.59 | 0.264 | 0.12 |
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