Cloning and Sequencing of Breed specific DNA Fragment in Cattle = 소의 품종 특이 DNA 표지인자의 분리와 염기서열 분석

국문 초록 (Abstract)

본 연구는 소의 품종을 구분하는 품종특이 표지인자를 클로닝하고 염기서열을 분석하기 위하여 수행되었다. 임의의 primer UBC376을 이용한 RAPD분석에서 홀스타인과 다른 품종을 구분하는 홀스타인 특이 DNA 밴드가 관찰되었다.
홀스타인 특이 밴드 UBS376-H1500을 다른 품종에서는 출현하지 않고 홀스타인에서만 관찰되었다. UBS376-H1500의 분자유전학적 특징을 밝히기 위해 클로닝하였다. 클로닝된 유전자를 probe로 RAPD 산물과 Hybridization시켰을 매 오직 홀스타인에서만 신로가 나타났고, 다른 품종의 RAPD 산물에서는 나타나지 않았다. Genomic DNA를 Souther blotting을 실시
한 결과 홀스타인 특이 RAPD 산물은 Sing1e copy임을 알 수 있었다. 홀스타인 특이 표지인자의 염기서열을 부분적으로 결정한 결과 돼지의 Na+, K+ ATPase mRNA의 alpha Suhunit와 66%, taryl coenzyme Areductase와 65% 그리고 소의 575 boySTSOO09 Clone
와는 82%의 유사성을 보였다.

다국어 초록 (Multilingual Abstract)

RAPD(Random amplified polymorphic DNA) markers generated by short oligonucleotide primers of random sequences have been successfully employed to detect genetic polymorphisms between cattle breeds. We were able rapidly to identify markers which distinguish Holstein from Hanwoo, or Hanwoo from charolais and Angus. PCR products from four primers(UBC 97, UBC 126, UBC 376, and UBC 119).
Clearly identified marker differentiation between cattle breeds. The primer UBE376 of seven generated polymorphic DNA fragment were specific for Holstein, being present only in Holstein but absent in others breed. We cloned the Holstein specific allelic marker UBS 376-H 1100 and the result of southern blotting with cattle genomic DNA showed that this fragment was hybridized only in Holstein. This result demonstrates that this(UBS 376-H 1100) is non repetitial sequence. Therefore, these RAPD bands specifie to breed have potential possibility for genetic marker for specific breed. RAPD bands specific for Hanwoo could be used to distinguish the Hanwoo meat from imported or Holstein meat, as a reference marker for misidentified Hanwoo in consumer market Genetic resource in korea.