프로테오믹스 방법을 이용한 인간 SOD1 단백질과 상호작용하는 효모 단백질들의 탐색 = A Proteomic Analysis of Yeast Proteins Interacting With Human SOD1 Protein
저자
발행기관
서울여자대학교(The Natural Science Institute Seoul Women's University)
학술지명
권호사항
발행연도
2010
작성언어
Korean
주제어
KDC
400
자료형태
학술저널
수록면
97-110(14쪽)
제공처
소장기관
Amyotrophic lateral sclerosis (ALS) is a neurologic disease that rapidly progresses and causes death within 5 years of the onset of symptoms. Mutations of SOD1 gene have been linked to familial cases of ALS (fALS). Although many hypotheses have been suggested, the role of SOD1 in ALS pathogenesis still remains unclear. A hallmark for ALS is the presence of intracellular inclusions containing mutant SOD1 and ubiquitin, suggesting that cells attempt to eliminate SOD1 proteins by ubiquitin-proteasome system.
Possibly the neuronal cells' failure to promptly eliminate unfolded SOD1 proteins leads to the protein accumulation and the eventual neuronal death. To study the role of ubiquitin-proteasome system in the degradation of mutant SOD1 proteins, we used yeast Saccharomyces cerevisiae as a model system. When being expressed in yeast, G93A mutant of hSOD1 was degraded rapidly, while wild-type SOD1 was stable. Most of SOD1 expressed in yeast, unlike in mammalian cells, remained soluble.
To identify proteins interacting with SOD1 and investigate their roles in the SOD1 degradation, we immunoprecipitated SOD1 and analyzed the binding partners by 2-DE followed by MALDI-TOF mass spectrometry.
We found that chaperone proteins (hsp26 and GrpE) as well as a proteasomal subunit (Rpn9) bound to SOD1, indicating that yeast recognizes SOD1 as abnormal proteins and eliminate them efficiently.
서론 2
재료 및 방법 3
시약 및 실험재료 3
효모의 배양 4
SDS-PAGE와 Western-blot 분석 4
면역침전법 4
효모 세포에서의 SOD1 단백질 분해도의 측정 5
효모 세포에서의 SOD1 단백질 용해도의 조사 5
이차원 전기 영동 5
1차원 전기영동 5
2차원 전기영동 5
Silver 염색 5
염색된 단백질의 탈색과 in-gel trypsindigestion 6
MALDI-TOF Mass Spectrometry 분석 6
데이터 베이스 검색 6
결과 및 고찰 7
인간 SOD1 단백질의 효모 내에서의 발현 확인과 반감기 조사 7
인간 SOD1 단백질의 용해도 분석 8
면역침전과 2차원 전기영동을 이용한 인간 SOD1 단백질과 결합하는 효모단백질들의 분리 및 MALDI-TOF 분석을 통한 동정 9
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