KCI등재
SCOPUS
SCIE
Evolutionary dynamics of transposable elements during silkworm domestication
저자
Min‑Jin Han (Southwest University) ; Hong‑En Xu (Zhengzhou University) ; Xiao‑Min Xiong (Jiujiang University) ; Hua‑Hao Zhang (Jiujiang University) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
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2018
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English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
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학술저널
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1041-1051(11쪽)
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0
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Although there are some documented examples on population dynamics of transposable elements (TEs) in model organisms, the evolutionary dynamics of TEs in domesticated species has not been systematically investigated. The objective of this study is to understand population dynamics of TEs during silkworm domestication. In this work, using transposondisplay we examined the polymorphism of seven TE families [they represent about 59% of silkworm (Bombyx mori) total TE content] in four domesticated silkworm populations and one wild silkworm population. Maximum likelihood (ML) was used to estimate selection pressure. Population differentiation and structure were performed by using AMOVA analysis and program DISTRUCT, respectively. The results of transposon-display showed that significant differentiation occurred between the domesticated silkworm and wild silkworm. These TEs have experienced expansions and fixation in the domesticated silkworm but not in wild silkworm. Furthermore, the ML results indicated that purifying selection of TEs in the domesticated silkworm were significantly weaker than that in the wild silkworm. Interestingly, an adaptation insertion induced by BmMITE-2 was found, and this insertion can reduce the polymorphism of the flanking regions of its neighboring COQ7 gene. Our results suggested that TEs expanded and were fixed in the domesticated silkworm might result from demographic effects and artificial selection during domestication. We concluded that the data presented in this study have general implication in animal and crop improvements as well as in domestication of new species.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2012-05-07 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국유전학회지 -> Genes & Genomics | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-04-14 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Genetics -> Genes and Genomics | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.51 | 0.12 | 0.38 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.32 | 0.27 | 0.258 | 0.02 |
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