분자운동론에 의한 Met-enkephalin의 모의 가열냉각구조 = Simulated Annealing Structures of Met - enkephalin by Molecular Dynamics
저자
발행기관
漢陽大學校 基礎科學硏究所(The Research Institute for Natural Sciences Hanyang University)
학술지명
권호사항
발행연도
1995
작성언어
Korean
KDC
404
자료형태
학술저널
수록면
269-276(8쪽)
제공처
소장기관
생명현상을 조절하는 신경전달체나 호르몬의 대부분은 수백개 정도의 원자를 포함하는 중간 크기의 분자이다. 생체내에서 이들 분자의 작용구조를 결정하는데 따르는 여러가지 어려움을 극복하기 위하여 이론적 접근방법인 모의 가열냉각실험이 시도되었다. 모의 가열냉각실험에서는 Monte Carlo법 또는 분자운동론법을 채택할수 있다. 본 연구에서 Met - enkephalin을 대상으로 분자운동론 모의 실험을 수행하여 이를 모의 가열냉각에 채택하는 것에 대한 실효성을 조사하였다. 분자운동론 모의실험결과 생성되는 궤적이 방대한 상태공간을 거치게 되므로 분자 형태 분류방법을 향상시킬 필요가 있다.
더보기Neurotransmitters and hormones are mid - size molecules of hundreds of atoms and control life phenomena. In order to overcome difficulties in determing the active conformation of these molecules in vivo, we have tried a simulated annealing procedure. One can employ either molecular dynamics or Monte Carlo technique for simulated annealing. We carried out molecular dynamics based annealing simulation with a molecular model of Met - enkephalin and evaluate the feasibility of using molecular dynamics simulation techniques in the simulated annealing procedure. We find that it is necessary to devise a refined classification for molecular conformations to deal with trajectories on the vast phase space.
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