생물학적 자극 통제 수단으로 활용하기 위한 돼지 페로몬성 냄새 물질의 탐색 3 : 2-(Cyclohexyloxy) Tetrahydrofurane 유도체와 Porcine Odorant Binding Protein 사이의 결합 친화력에 관한 비교 분자장 분석
저자
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2006
작성언어
Korean
주제어
KDC
527
등재정보
01
자료형태
학술저널
수록면
13-19(7쪽)
제공처
소장기관
생물학적 자극통제 수단으로 활용하기 위한 돼지 웅성 페르몬성 분자를 탐색하고자 일련의 냄새 분자로서 2-(cyclo-hexyloxy) tetrahydrofurane 유도체들의 정량적인 구조와 수용체인 porcine odorant binding protein (pOBP)간의 결합 친화력 상수(p(Od)50)에 대한 비교 분자장 분석(CoMFA)을 실행하였다. 가장 양호한 CoMFA 모델 AIV (r2 cv.(q2)=0.886 및 r2 ncv.=0.984)은 기질 분자 내 입체 중심(chiral center)의 절대 배열이 C1(R),C2(S)인 분자를 atom based fit 방법으로 배열하였을 경우의 standard field와 indicator field가 조합된 CoMFA장의 조건에서 유도되었다. 이 CoMFA 모델은 입체장 40.8% 정전기장 14.6%및 소수성장 44.6%가 결합 친화력 상수에 영향을 미치는 요소임을 나타내었다. 등고도의 분석 결과로부터 효과적인 결합 친화력 냄새 분자를 수식하는 데 몇 가지 가치 있는 정보를 얻을 수 있었다.
더보기To search of new porcine pheromonal odorants for biostimulation control system technologies to improve reproductive efficiency in livestock species, the comparative molecular field analysis (CoMFA) for binding affinity constant (p(Od)50) between porcine odorant binding protein (pOBP) and ligands of odorant 2-(cyclohexyloxy) tetrahydrofurane derivatives as substrate molecule was conducted and discussed. In the optimized CoMFA model AIV with chirality (C1'(R), C2(S)) in substrate molecule and atom based fit alignment (A) of odorants, the statistical results showed the best predictability of the binding affinities (p(Od)50) based on the LOO cross-validated value r2 cv.(q2=0.886) and non-cross-validated conventional coefficient (r2 ncv.=0.984). the binding affinity constants exhibited a good correlation with steric (40.8%), electrostatic (14.6%) and hydrophobic (44.6%) factors of the substrate molecules. from the analytical results of the contour maps, which may give us some valuable informations to the modification of odorants for effective binding affinity.
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