KCI등재
SCOPUS
SCIE
The isolation and identification of salt-responsive novel microRNAs from Salicornia brachiata, an extreme halophyte
저자
Dinkar Singh (CSIR-Central Salt and Marine Chemicals Research Institute) ; Bhavanath Jha (CSIR-Central Salt and Marine Chemicals Research Institute)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2014
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
325-336(12쪽)
KCI 피인용횟수
9
제공처
The small, non-coding RNA species (20–24nucleotides), including microRNAs (miRNAs) and smallinterfering RNAs, are key regulators of gene expression ineukaryotic cells. Mostly, miRNAs have been identifiedfrom glycophytes under different abiotic stresses. Theisolation and identification of miRNAs from halophytes arechallenging due to the presence of high salt concentrations.
In this study, small RNA cDNA libraries were constructedusing an improved method to identify salt-responsive novelmiRNAs from Salicornia brachiata. A total of 159sequences were cloned and analysed. There was no adaptercontamination and low-abundance small RNAs wereamplified efficiently. Twelve putative miRNAs/pre-miRNAsand a small RNA were identified and confirmed bynorthern blot. Among the putative miRNAs, nine are noveland three belong to the conserved miRNA families(MIR169g, MIR1433, MIR138b). Northern hybridisationand real-time PCR showed that nine miRNAs (seven noveland two conserved) and one small RNA were highlyexpressed at 2.0 M NaCl, two novel miRNAs at 1.5 MNaCl, and one conserved miRNA at 1.0 M NaCl. Furthermore,67 putative target genes of the isolated miRNAwere predicted on the basis of sequence homology, ofwhich more than 50 % are associated with abiotic stresses.
The target genes of miRNA 169g (Sb-miRNA10), and SbmiRNA7(NF-YA transcription factor and cytochromeP450-like TATA box binding protein respectively) wereanalysed by real-time PCR. The study of miRNAs from anextreme halophyte broadens our understanding of theimportant role played by miRNAs in plant abiotic stress.
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-01-01 | 평가 | SCIE 등재 (신규평가) | KCI후보 |
2005-10-31 | 학회명변경 | 영문명 : Korea Society Of Plant Biotechnology -> Korean Society for Plant Biotechnology |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.42 | 0.21 | 0.88 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.71 | 0.59 | 0.264 | 0.12 |
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