KCI등재
Development of a Nuclease Protection Assay With Sandwich Hybridization (NPA-SH) to Monitor Heterosigma akashiwo
저자
Mingyeong Kang(강민경) ; Mirye Park(박미례) ; Kang Eun Kim(김강은) ; Taek-Kyun Lee(이택견) 연구자관계분석
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2020
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English
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KCI등재
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학술저널
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26-31(6쪽)
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Heterosigma akashiwo는 전세계적으로 분포된 침편모조류이며, 대발생을 형성하여 많은 나라의 양식산업에 커다란 손실을 유발시킨다. 따라서 빠르고 민감한 검출방법을 개발하는 것은 유해조류 대발생에 대한 적절한 경보를 위해서 필요하다. 이 연구에서는 H. akashiwo를 정성 및 정량적으로 검출하기 위하여 뉴클레아제 보호 분석이 통합된 샌드위치 혼성(NPA-SH)을 개발하였다. NPA-SH 프로브는 여섯 종의 미세조류 핵산 서열을 이용하여 디자인 후, 특이성을 확인하여 capture 프로브와 signal 프로브를 선정하였다. 배양시료와 현장시료를 이용하여 NPA-SH의 적용성을 평가한 결과, NPA-SH의 좋은 적용성과 효과를 확인하였다. H.akashiwo의 정량분석을 위한 선형회귀식을 확인하였으며, 최소 검출한계는 1×10⁴ cells/ml이었다. NPA-SH를 사용하여 얻은 H. akashiwo의 정량결과와 현미경을 사용하여 얻은 결과 사이에는 통계학적으로 유의한 차이는 없었다. NPA-SH 분석은 환경시료에 잘 적용되었다. 이러한 결과는 NPA-SH가 H. akashiwo의 모니터링에 사용되어 왔던 전통적인 현미경적 방법에 대한 좋은 대안이 될 수 있음을 보여준다.
더보기Heterosigma akashiwo is a globally distributed raphidophyte that forms blooms and causes significant losses to the aquaculture industry in many coastal countries. The development of a fast and sensitive detection method is therefore required to facilitate the appropriate warning of harmful algal blooms. In this study, a nuclease protection integrated with sandwich hybridization (NPA-SH) assay was developed to both qualitatively and quantitatively detect H. akashiwo. The NPA, capture and signal probes were designed by nucleotide sequencing of H. akashiwo. The applicability of NPA-SH was evaluated using cultured H. akashiwo cells and field samples collected at Goseong Bay, Korea. The results show that this method has good applicability and effectiveness in analyzing cultured cells and field samples. A linear regression equation for the quantitative analysis of H. akashiwo was obtained, and the lower detection limit of the assay was 1×10⁴ cells/ml. There was no statistically significant difference in the results of H. akashiwo quantitation using NPA-SH compared to those obtained using a microscope. These results indicate that NPA-SH can be a good alternative to the traditional microscopic method used to monitor H. akashiwo.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2027 | 평가예정 | 재인증평가 신청대상 (재인증) | |
2021-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (재인증) | KCI등재 |
2018-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2011-08-03 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Life Science -> Journal of Life Science | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2001-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.37 | 0.37 | 0.42 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.43 | 0.43 | 0.774 | 0.09 |
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