JBR(Jeju Island Bovine Rotavirus)의 Sequencing에 의한 Homology 비교에 관한 연구 = The Studies on the Homology by Sequence of JBR
저자
이종익 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 谷口孝喜 (일본 사뽀로 의과대학) ; 김응률 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 류영수 (국립수의과학연구소) ; 박선오 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 송진욱 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 유제현 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 조홍찬 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 차광종 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 浦澤正三 (일본 사뽀로 의과대학) ; 이태협 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 김유성 (건국대학교 축산대학 낙농학과) ; 이영건 (건국대학교 축산대학 낙농학과)
발행기관
건국대학교 동물자원연구센터(Animal Resources Research Center Kon-Kuk University)
학술지명
권호사항
발행연도
1998
작성언어
Korean
주제어
KDC
527.05
자료형태
학술저널
수록면
19-24(6쪽)
제공처
본 연구는 PCR에 의해 로타바이러스의 serotype을 결정하고 염기배열의 유사성을 다른 지역에서 발견된 로타바이러스와 비교 분석하였으며 그 결과는 다음과 같다.
1. 제주도 목장에서 송아지 설사변을 채취하여 로타바이러스를 분리 후 MA104세포에 감염시켜 세포변성 효과(CPE)를 확인하였다.
2. 전자현미경에 의해 형태학적로 로타바이러스임이 판명되었으며 형광항체법에 의해 MA104세포에 감염된 것을 재확인 하였다.
3. 제주도 송아지 로타바이러스(JBR)RNA를 PAGE에 의해 genotype를 분석한 결과 bovine특유의 4:2:3:2 pattern이지만 일반 PAGE로 분석한 결과는 NCDV, UK, KK3, A5-37, 61A, B223와 차이가 있었으며, Ns-5, Nc-5, Kawatabi(Japan)와는 비슷한 경향을 보였다.
4. Plaquing 후 titer한 결과 NCDV, UK보다는 낮은 ??PFU/ml이었다.
5. RNA-RAN hybridization과 ELISA 및 VP7과 VP4의 1차, 2차 PCR 사물을 1% agarose(EtBr 1㎕의 TAE)에서 전기영동한 결과 G6P11의 serotype이었다.
6. JBR의 P serotype이 동일하게 나타난 B223과의 비교 결과 총 JVP8 750 bases 중에서 731개의 염기가 B223과 같은 것으로 나타나 염기배열의 유사성은 97.47%로 나타났고, 아미노산 배열의 유사성은 97.57%로 나타났다.
This study was carried our to identify JBR's serotype by polymerase chain reaction(PCR) and to analyze homology of JBR' sequence.
The results obtained in these experiments were as follows:
1. Fecal samples of calf diarrhea were taken on farms in Jeju island, rotavirus was isolated and cytopathic effect(CPE) was determined after infection to MA104 cell.
2. Morphological evaluation on electron microscopy proved it as rotavirus. Also, its infection to MA104 cell was reidentified using a fluorescence antibody method.
3. Genotype of Jeju island bovine rotavirus(JBR) analyzed thorough PAGE was 4:2:3:2 pattern, which was unique in bovine and that analyzed through general PAGE was somewhat different from NCDV, UK, KK3, A5-37, 61A, B223 and similar to Nstool-5, N cultrue-5 and Kawatabi(Japan).
4. By titration after plaquing, the level was ??PEU/ml, which was lower than those of NCDV and UK.
5. Electrophoresis analysis of RNA-RNA hybridization. ELISA, adn first and second PCR products of VP7 and VP4 in 1% agarose(TAE+1㎕ EtBr) revealed that the rotavirus was a serotype of G6P11.
6. Alignment of two(JBR and B223) amino acid sequences is 97.57% and nucleotide sequences is 97.47%.
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