SCOPUS
SCIE
Ramlibacter rhizophilus sp. nov., isolated from rhizosphere soil of national flower Mugunghwa from South Korea
저자
Yan, Zheng-Fei ; Trinh, Huan ; Moya, Gabriela ; Lin, Pei ; Li, Chang-Tian ; Kook, MooChang ; Yi, Tae-Hoo
발행기관
학술지명
International journal of systematic and evolutionary microbiology
권호사항
발행연도
2017
작성언어
-등재정보
SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
3773-3777(5쪽)
제공처
<P>A Gram-negative, aerobic, non-motile, long rods or coccoid without flagellum strain, designated THG-YS3.2.7(T), was isolated from therhizosphere soil of a Mugunghwa flower collected from Kyung Hee University, Yongin, South Korea. Growth occurred at 10-40 degrees C (optimum 28-37 degrees C), at pH 6-8 (optimum 7) and at 0-5% NaCl (optimum 1 %). The predominant ubiquinone was ubiquinone 8 (Q-8). The major cellular fatty acids were C-10 : 0, C-10 : 0 3OH, C-16 : 0, C-17 : 0, C-17 : 0 cyclo, C-18 : 0, C(18 : 3 omega)6c (6,9,12), summed feature 3 (C-16 (: 1)omega 7c and/or C-16 : 1 omega 6c) and summed feature 8 (C-18 : 1 omega 7c and/or C-18 : 1 omega 6c). The major polar lipids were diphosphatidylglycerol (DPG), phosphatidylglycerol (PG), phosphatidylethanolamine (PE), phosphatidylcholine (PC). The DNA G+C content of strain THG-YS3.2.7(T) was 69.4 mol%. Based on 16S rRNA gene sequence analysis, the nearest phylogenetic neighbours of strain THG-YS3.2.7(T) were identified as Ramlibacter henchirensis DSM 14656(T) (97.92 %), Ramlibacter tataouinensis DSM 14655(T) (97.90 %), Ramlibacter solisilvae KACC 17567(T) (97.04 %). DNA-DNA hybridization values between strain THG-YS3.2.7(T) and R. henchirensis DSM 14656(T), R. tataouinensis DSM 14655(T), R. solisilvae KACC 17567(T) were 32.5 +/- 1.5, 43.1 +/- 1.1, 42.8 +/- 1.1 %, respectively. On the basis of the phylogenetic analysis, chemotaxonomic data, physiological characteristics and DNA-DNA hybridization data, strain THG-YS3.2.7(T) represent a novel species of the genus Ramlibacter, for which the name Ramlibacter rhizophilus sp. nov. is proposed. The type strain is THG-YS3.2.7(T) (= KCTC 52083(T) = CCTCC AB 2015357(T)).</P>
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