대장균 frp 프로모터와 SoxS의 상호작용 = Interaction of SoxS with the upstream sequence of the fpr promoter of Escherichia coli
저자
고영상 (제주대학교 의과대학 미생물실)
발행기관
제주대학교 생명과학연구소(Institute of Life Science Cheju National University)
학술지명
권호사항
발행연도
1998
작성언어
English
주제어
KDC
470
자료형태
학술저널
수록면
41-48(8쪽)
제공처
fpr 유전자는 대장균에서 NADPH:ferredoxin oxidoreductase를 코딩하는 유전자로서 슈퍼 옥사이드 스트레스 시 유도되는 soxRS 조절군에 속한다. 순수 분리한 SoxS 전사조절단백 질이 fpr 프로모터 상위부위에 결합함을 gel mobility shift와 DNase I protection 분석을 통하여 관찰하였다. SoxS 단백질은 fpr 프로모터 상위부위에 결합하여 -69에서 -49 사이의 염기서열을 DNase I 절단으로부터 보호하였다. 이 부위에서 SoxS 결합부위 (soxbox) 염기 서열이 soxRS조절군에 속하는 다른 유전자의 경우와 그 방향성이 반대로 나타났다. RNA 중합효소에 의한 fpr 프로모터의 전사가 SoxS 첨가에 의하여 활성화됨을 in vitro에서 관찰하였다. 이상의 결과들은 SoxS 단백질이 fpr 프로모터 상위부위의 soxbox에 결합하며 fpr 유전자의 경우 soxbox의 방향성이 반대로 위치함을 시사한다. SoxS RNA 중합효소 간의 상호작용에 대하여 고찰하였다.
The fpr gene, encoding NADPH:ferredoxin oxidoreductase in Escherichia coli, is a member of the soxRS regulon, induced by superoxide-generating agents. The binding of the purified SoxS protein to the fpr promoter upstream sequence was demonstrated by gel mobility shift and DNase I protection assays. Purified SoxS protein bound to the fpr promoter and protected nucleotides between -69 and -49 from DNase I cleavage. This region contains a soxSbinding (soxbox) sequence in reverse orientation. The in vitro transcription from the fpr promoter by RNA polymerse was activated by addition of purified SoxS. these results suggest that SoxS binds to the soxbox sequence in reverse orientation in the fpr gene unlike in other known genes of the soxRS regulon. Possible modes of interaction between SoxS and RNA polymerase were presented.
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