KCI등재
SCOPUS
SCIE
Transcriptome analysis of rice leaves in response to Rhizoctonia solani infection and reveals a novel regulatory mechanism
저자
De Peng Yuan (Shenyang Agricultural University) ; Xiao Feng Xu (Shenyang Agricultural University) ; Hong Woo-Jong (경희대학교) ; Si Ting Wang (Shenyang Agricultural University) ; Xin Tong Jia (Shenyang Agricultural University) ; Yang Liu (Shenyang Agricultural University) ; Shuang Li (Yan’an University) ; Zhi Min Li (Shenyang Agricultural University) ; Qian Sun (Shenyang Agricultural University) ; Qiong Mei (Shenyang Agricultural University) ; Shuai Li (Shenyang Agricultural University) ; 정기홍 (경희대학교) ; Song Hong Wei (Shenyang Agricultural University) ; Yuan Hu Xuan (Shenyang Agricultural University)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2020
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS,SCIE
자료형태
학술저널
수록면
559-573(15쪽)
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Sheath blight disease (ShB) severely afects rice production; however, the details of defense against ShB remain unclear. To understand the rice defense mechanism against ShB, an RNA sequencing analysis was performed using Rhizoctonia solani inoculated rice leaves after 48 h of inoculation. Among them, 3417 genes were upregulated and 2532 were downregulated when compared with the control group (>twofold or<1/2). In addition, the diferentially expressed genes were classifed via Gene Ontology (GO), Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG), and MapMan analyses. Fifty-nine GO terms and seven KEGG pathways were signifcantly enriched. A MapMan analysis demonstrated that the phytohormone and metabolic pathways were signifcantly altered. Interestingly, the expression levels of 359 transcription factors, including WRKY, MYB, and NAC family members, as well as 239 transporter genes, including ABC, MFS, and SWEET, were signifcantly changed in response to R. solani AG1-IA inoculation. Additionally, OsWRKY53 and OsAKT1 negatively regulate the defense response in rice against R. solani via gain of function study for OsWRKY53 and loss of function study for OsAKT1, respectively. Furthermore, several diferentially expressed genes contain R. solani-responsive cis acting regulatory elements in their promoter regions. Taken together, our analyses provide valuable information for the additional study of the defense mechanisms against ShB, and the candidate genes identifed in this study will be useful resource for future breeding to enhance resistance against ShB.
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2012-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2009-01-01 | 평가 | SCIE 등재 (신규평가) | KCI후보 |
2005-10-31 | 학회명변경 | 영문명 : Korea Society Of Plant Biotechnology -> Korean Society for Plant Biotechnology |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 1.42 | 0.21 | 0.88 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.71 | 0.59 | 0.264 | 0.12 |
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