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Molecular Identification and Expression Analysis of Carbonic Anhydrase VII in Pufferfish (Takifugu rubripes)
저자
Kanij Rukshana Sumi (Chonnam National University) ; 김수철 (전남대학교) ; Jewel Howlader (순천대학교) ; Md Rajib Sharker (Chonnam National University) ; 최갑성 (순천대학교 식품과학부) ; 최상기 (순천대학교) ; 박종인 (순천대학교) ; 노일섭 (순천대학교) ; 고강희 (전남대학교)
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2019
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English
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KCI등재
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학술저널
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363-374(12쪽)
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A carbonic anhydrase VII gene, encoding 277 amino acids, was identified in the intestinal tissue of pufferfish (Takifugu rubripes). The translated protein with an 833-bp complete coding sequence derived from the 1378-bp cloned sequence showed 83% identity with swamp eel CA VII, 76% with zebrafish CA VII, and 77% with coho salmon CA VII-like protein. The cloned protein also showed 68–69% identity with mammalian CA VII. The predicted molecular weight and iso-electric point of the protein were 30.84 kDa and 6.07, respectively. Active site analysis of the pufferfish CA VII indicated that most of the important residues involved in catalytic activity were highly conserved, whereas four cysteine residues at positions 55, 103, 184, and 275 differed from those in human CA II, and were related to cell-defense mechanisms against oxidative damage. Phylogenetic analysis showed that the cloned sequence was clustered within the fish CA VII clade and close to the swamp eel CA VII. Structural modeling of the pufferfish CA VII protein revealed the conservation of zinc binding histidine residues (zinc ion and histidine residues). Differential expression patterns of the pufferfish CA VII were determined with semiquantitative reverse transcription (RT)-PCR and quantitative PCR (q-PCR) as well. The results of q-PCR revealed that the pufferfish CA VII was highly expressed in intestinal tissue. The pufferfish CA VII was also detected within intestinal tissue sections using an in situ hybridization assay.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2014-03-31 | 학회명변경 | 한글명 : 한국해양연구원 -> 한국해양과학기술원영문명 : Korea Ocean Research and Development Institute -> Korea Institute of Ocean Science & Technology | KCI등재 |
2014-01-01 | 평가 | SCOPUS 등재 (등재유지) | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2006-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보2차) | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.7 | 0.11 | 0.59 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.48 | 0.46 | 0.326 | 0.12 |
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