KCI등재
SCOPUS
Identification of Genus Vigna using ITS2 and matK as a Two-Locus DNA Barcode = Identification of Genus Vigna using ITS2 and matK as a Two-Locus DNA Barcode
저자
( Sebastin Raveendar ) (농촌진흥청 국립농업과학원) ; ( Jung Ro Lee ) ; ( Jae Wan Park ) ; ( Gi An Lee ) ; ( Young Ah Jeon ) ; ( Won Hee Lee ) ; ( Gyu Taek Cho ) ; ( Kyung Ho Ma ) ; ( Sok Young Lee ) ; ( Jong Wook Chung ) 연구자관계분석
발행기관
학술지명
Plant Breeding and Biotechnology(Plant Breeding and Biotechnology)
권호사항
발행연도
2015
작성언어
-주제어
KDC
500
등재정보
KCI등재,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
153-159(7쪽)
DOI식별코드
제공처
DNA barcoding is the use of short DNA sequences of the genome for large scale species identification. The Consortium for the Barcode of Life (CBOL) plant-working group recommended a 2-locus combination as the standard plant barcode. The evolutions of the chloroplast regions combined with nuclear gens are sufficiently rapid to allow discrimination between closely related species. We evaluated the efficacy of the proposed plant barcoding loci, matK, along with ITS2 for barcoding the Vigna species. To assess the discriminatory ability of barcoding loci for identifying the Vigna species, we sampled 52 of the taxonomically best known groups in the genus. Topologies of the phylogenetic trees based on ITS2 and matK analyses were similar but a few accessions were placed into distant phylogenetic groups. Neither ITS2 nor matK analyses were able to discriminate some closely related Vigna species. Thus, we used concatenated data to increase the resolving power of ITS2 and used matK as an additional tool for phylogenetic analysis in Vigna because characterization of the nucleotide sequences of the matK region was easier and more cost-effective than that of the ITS region.
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