박의 RAPD 분석을 위한 PCR 최적 조건 연구 = PCR Optimization for RAPD Analysis in Gourd
저자
김보경 (밀양대학교 식물자원학과) ; 김성만 (밀양대학교 식물자원학과) ; 김용철 (밀양대학교 식물자원학과) ; 이충열 (밀양대학교 식물자원학과) ; 박현철 (밀양대학교 식물자원학과) ; 최인수 (밀양대학교 식물자원학과)
발행기관
밀양대학교 농업기술개발연구소(AGRICULTURAL TECHNOLOGY & DEVELOPMENT INSTITUTE MIRYANG NATIONAL UNIVERSITY)
학술지명
農業技術開發硏究所報(JOURNAL OF AGRICULTURAL TECHNOLOGY & DEVELOPMENT INSTITUTE)
권호사항
발행연도
2000
작성언어
Korean
주제어
KDC
520.000
자료형태
학술저널
수록면
63-70(8쪽)
제공처
This study was conducted to identify the best combinations of factors(template DNA concentration, MgCl2 concentration, and amount of taq polymerase) for the optimization of PCR in gourd. 3×3×3 factorial experiment for template DNA concentration, MgCl2 concentration, and amount of taq polymerase was conducted. Another factorial experiment for denature, annealing, extension temperature on the optimal PCR condition was also conducted. The most clear and reproducible bands were appeared in 40ng(1unit taq polymerase and 2.5mM MgCl2, and lunit taq polymerase and 4.5mM MgCl2, 1unit taq polymerase and 7.0mM MgCl2), 60ng(0.5unit taq polymerase and 2.5mM MgCl2, 0.5unit taq polymerase and 4.5mM MgCl2, 1unit taq polymerase and 2.5mM MgCl2, 1unit taq polymerase and 4.5mM MgCl2, and 1unit taq polymerase and 7.0mM MgCl2). The best MgCl2 concentration was 4.5mM(40ng template DNA and 1unit taq polymerase, 60ng template DNA and 0.5unit taq polymerase, and 60ng template DNA and lunit taq polymerase), and 7.0mM(40ng template DNA and 0.5unit taq polymerase DNA). The combinations which showed the best bands from the amount of taq polymerase were 0.5unit(60ng template DNA and 4.5mM MgCl2) and lunit(40ng template DNA and 2.5mM MgCl2, 40ng template DNA and 4.5mM MgCl2, 40ng template DNA and 7.0mM MgCl2, 60ng template DNA and 2.5mM MgCl2, 60ng template DNA and 4.5mM MgCl2, 60ng template DNA and 7.0mM MgCl2). When we consider results from template DNA concentration, MgCl2 concentration, and amount of taq polymerase, 1 condition(40ng of template DNA, 4.5mM MgCl2 and 1unit taq polymerase) was the best combination for the optimal PCR condition. Reaction temperatures for the optimal PCR condition were 84℃, 32℃, 62℃ and 86℃, 35℃, 64℃.
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