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Human Endogenous Retrovirus K (HERV-K) can drive gene expression as a promoter in Caenorhabditis elegans
저자
Serpen Durnaoglu (Hanyang University) ; 김희수 (부산대학교) ; Joohong Ahnn (Hanyang University) ; 이선경 (한양대학교) 연구자관계분석
발행기관
생화학분자생물학회(Korean Society for Biochemistry and Molecular Biology)
학술지명
권호사항
발행연도
2020
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English
주제어
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
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학술저널
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521-526(6쪽)
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Endogenous retroviruses (ERVs) are retrotransposons present in various metazoan genomes and have been implicated in metazoan evolution as well as in nematodes and humans. The long terminal repeat (LTR) retrotransposons contain several regulatory sequences including promoters and enhancers that regulate endogenous gene expression and thereby control organismal development and response to environmental change. ERVs including the LTR retrotransposons constitute 8% of the human genome and less than 0.6% of the Caenorhabditis elegans (C. elegans) genome, a nematode genetic model system. To investigate the evolutionarily conserved mechanism behind the transcriptional activity of retrotransposons, we generated a transgenic worm model driving green fluorescent protein (GFP) expression using Human endogenous retroviruses (HERV)-K LTR as a promoter. The promoter activity of HERV-K LTR was robust and fluorescence was observed in various tissues throughout the developmental process. Interestingly, persistent GFP expression was specifically detected in the adult vulva muscle. Using deletion constructs, we found that the region from positions 675 to 868 containing the TATA box was necessary for promoter activity driving gene expression in the vulva. Interestingly, we found that the promoter activity of the LTR was dependent on che-1 transcription factor, a sensory neuron driver, and lin-15b, a negative regulator of RNAi and germline gene expression. These results suggest evolutionary conservation of the LTR retrotransposon activity in transcriptional regulation as well as the possibility of che-1 function in non-neuronal tissues.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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학술지등록 | 한글명 : BMB reports외국어명 : BMB reports | ||
2024 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2021-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2020-12-01 | 평가 | 등재후보로 하락 (해외등재 학술지 평가) | KCI후보 |
2013-07-17 | 학술지명변경 | 한글명 : BMB reports -> BMB Reports외국어명 : BMB reports -> BMB Reports | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-09-21 | 학회명변경 | 한글명 : 대한생화학ㆍ분자생물학회 -> 생화학분자생물학회영문명 : Korean Society Of Medical Biochemistry And Molecular Biology -> Korean Society Of Biochemistry And Molecular Biology | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2005-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2002-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
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2016 | 2.76 | 0.5 | 1.94 |
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1.45 | 1.12 | 0.646 | 0.12 |
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