KCI등재
SCIE
SCOPUS
전기영동을 대체하는 효과적인 고추 순도검정 방법 = Efficient Purity Testing of F₁ Hybrid Seeds without Electrophoresis inChili Pepper (Capsicum annuum L.)
저자
발행기관
학술지명
원예과학기술지(Korean journal of horticultural science & technology)
권호사항
발행연도
2007
작성언어
Korean
주제어
KDC
525
등재정보
KCI등재,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
328-333(6쪽)
KCI 피인용횟수
0
제공처
소장기관
본 실험은 고추 일대교잡종 종자의 품질 향상을 위하여 국내외에서 생산된 종자들에 대한 유전적인 순도를 검정하는 방법을 개발하기 위하여, 최근에 개발되어 사용되기 시작한 RAPD(random amplified polymorphic DNA) 방법을 정확성, 재현성, 신속성, 경제성, 편의성 및 실용성 등의 측면에서 획기적으로 개선하기 위해 수행하였다. random decamer primer를 사용할 때에는 특이밴드이외에도 여러밴드가 생겨나기 때문에 필수적으로 전기영동과정을 거쳐야 순도검정이 가능하였지만, SCAR primer를 사용하면 오직 단일 친특이밴드만이 생기므로 PCR과정에서나 직후에 DNA 염색시약(ethidium bromide)을 사용하여 PCR tube 혹은 multiwell plate에서 직접 반응을 관찰하여 전기영동과정 없이도 용이하게 종자의 순도검정을 할 수 있게 되었다. 민간종묘회사에서 임의로 불순 종자를 혼입한 시료에 대하여 새로운 DNA 추출방법(NaOH 방법), SCAR primer 및 전기영동과정을 생략한 검정방법 등을 적용해 본 결과, 종묘회사에서 혼입시킨 불순 종자를 정확히 판별할 수 있었다. 모계특이표지인 DMM-1과 DMM-8을 사용하여 실제 순도검정한 결과 잎 200매와 종자 200립에서 전기영동을 행하지 않고 PCR과정에 EtBr을 사용하므로써 tube내에서 순도검정이 가능하였다.
더보기The study was performed to develop an efficient DNA detection method for the determination of the genetic purity of F₁ hybrid seeds essential for seeds production in chili pepper (Capsicum annuum L.). Testing methods of genetic purity of seeds, such as field test, electrophoresis of isozymes, DNA marker etc, are in current use. Recently the RAPD method has been developed and come into use as a means of testing the genetic purity of chili pepper seeds. Experiments were performed to make an improvement on the RAPD method for detecting DNA without electrophoresis. The accuracy, swiftness, easy access, practicability and cost efficiency of RAPD method were greatly improved after making SCAR primers. Specific SCAR primers made it possible to detect contaminated seeds without electrophoresis by PCR with mixture containing EtBr in 0.5 ㎖ tube, or direct visualization of amplified DNA fragment with EtBr at multiwell plate. Blind tests were conducted to confirm the applicability of this study. In the practical tests, P₁-specific primers (DMM-1 and DMM-8) could detect contaminated seeds without electrophoresis by PCR with mixture containing EtBr among 200 leaves and 200 seeds. P₂-specific primers (DMP-1 and DMP-2) could detect contaminated seeds with electrophoresis but not by PCR with mixture containing EtBr among 200 leaves and 200 seeds which seed company had supplied after adding other variety to samples, although it can not occur in real situation to harvest seeds. In conclusion, direct detection of the amplified DNA by PCR with mixture containing EtBr was found applicable for testing the purity of F1 seeds because it reduced the total test time from 24 hours to about 4 hours on 40 samples and improved the accuracy, easy access, cost efficiency and practicability.
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2017-02-08 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Horticultural Science & Technology -> Horticultural Science & Technology | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.92 | 0.74 | 0.83 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.77 | 0.73 | 1.115 | 0.19 |
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