KCI등재
Brucella abortus 국내 분리주의 36kDa 외막단백을 암호하는 omp2b 유전자의 염기 분석 = Sequence Analysis of the omp2b Gene Encoding 36kDa Outer Membrane Protein of Brucella abortus Isolates
B. abortus 국내 분리주의 분자유전학적 성상을 규명하고 분자역학적 연구에 필요한 기초자료를 얻기위해 36kDa OMP를 암호하는 omp2b 유전자를 PCR법으로 확인하고, 그리고 omp2b 유전자의 핵염기 서열과 아미노산 서열을 결정하고 이 결과를 Brucella 표준균주 및 여러 동물에서 분리된 Brucella 분리주와 상호 비교 분석하였던 바 다음과 같은 결과를 얻었다
1. B. abortus 분리주 (7주)에 대해 omp2b primers를 이용하여 PCR을 수행 한 바 공시한 참조균주와 분리균주 모두에서 1,251bp의 특이한 DNA 절편이 각각 증폭되었다
2. omp2b 유전자의 1,089bp에 대한 염기서열과 이에 대한 362개의 아미노산 서열을 결정하였다. 분리균주의 omp2b 유전자의 염기서열을 참조균주와 비교 분석한 결과 B. abortus 2308 (biovar 1) 및 B. abortus B3196 (biovar 5)과는 99.6%~l00% 및99.5%~99.9%의 매우 높은 상품성을 나타내었고, B. abortus 45/20 (biovar 1)과는 97.1%~97.4%의 상품성을 나타내었다. 또한 362개의 아미노산 서열에 대해 분석하였던 바, 분리균주들은 B. abortustus 2308 (biovar 1) 및 B. abortus B3196 (biovar 5)과는 99.2%~l00%의 매우 높은 상품성을 보였으며, B. abortus 45/20 (biovar 1)과는 96.4%~97.2%의 상품성을 보였다.
3. 본 시험에 공시된 브루셀라균주의 omp2b 유전자서열과 여러 동물에서 분리된 브루셀라 분리주의자료를 바탕으로 phylogenetic tree를 작성 한 바, 국내 분리주는 B. abortus 2308 (biovar 1), B. abortus B3196 (blovar 5), B. abortus 45/20 (biovar 1), B. suis 1330 (biovar 1), B. melitensis 16M (biovar 1), B. canis NCTC 01854, B. neotomae 5k33과 97.3%이상의 높은 근연성을 보이며 동일한 cluster에 소속되었으며, omp2b 유전자는 매우 잘 보존됨을 알 수 있었다.
omp2b gene of Brucella abortus isolates encoding 36kDa outer membrane protein (OW) was amplified by polymerase chain reaction (PCR) and the sequences of nucleotide and amino acid were determined and analyzed to obtain the basic data for molecular epidemiological features of brucellosis in Korea. In PCR using omp2b primers for the gene of 36kDa OMP, the specific signals at 1,251bp were demonstrated, The nucleotide sequences of omp2b gene of 1,089bp were sequenced by dye terminator cycle sequencing method, and 362 amino acid sequences were predicted. As compared the nucleotide sequences with those of B. abortus reference strains, the isolates showed the very high homology to the reference strains ranging 97.1%-100%. The similar results were also obtained in the analysis of the amino acid sequences. In the phylogenetic tree, the isolates clustered with the reference strains and the majority of strains originated from pig, dog, wood rat and cattle.
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