Pocine Adenovirus-3의 E1B Region의 鹽基序列 分析 = Sequence Analysis of the Early Region 1B(E1B) of Porcine Adenovirus Type 3
저자
朴鍾賢 (獸醫科學硏九所) ; 宋載永 (獸醫科學硏九所) ; 李重馥 (獸醫科學硏九所) ; 玄芳勳 (獸醫科學硏九所) ; 安東濬 (獸醫科學硏九所) ; 車相昊 (獸醫科學硏九所) ; 裵用泰 (獸醫科學硏九所) ; 姜永源 (獸醫科學硏九所) ; Reddy, P S (Virology group. Veterinary Infectious Disease Organization. Univ. of Saskatchewan) ; 全茂炯 (忠南大學校 獸醫科大學) ; 安壽煥 (獸醫科學硏九所)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
1999
작성언어
Korean
주제어
KDC
472.000
자료형태
학술저널
수록면
278-284(7쪽)
제공처
돼지 아데노바이러스(PAV-3). 6618주의 EIB region이 包含되어 있는 map unit 4.0에서 9.7까지의 유전자에 대한 1,984 bp의 염기서열을 決定하였으며, 이 結果를 알려진 여러 아데노바이러스 유전자와 비교하여 다음과 같은 결과를 얻었다.
1. PAV-3의 EIB유전자는 10개의 ORF로 구성되어 있으며, 그 중 아데노바이러스의 단백질과 유사성이 있는 것은 ORF1, ORF2 및 ORF3이었다. ORF1은 Ad41의 19kd 와 BAV-2에서의 EIB ORF2에서의 아미노산의 一致率은 각각 32%와 31%이었다.
2. ORF2는 Ad2 55kd protein과 tupaia adenovirus 44kd protein가 각각 34%로 아미노산 一致率이 가장 높았으며, Ad41의 52kd protein. BAV-3의 EIB ORF3에서도 33%의 一致率을 보였다.
3. ORF1은 61-666 uncleotide (606 bp), ORF 2에서는 429-1,850 uncleotide (1,422 bp)의 부위로 각각 202, 474 a.a로 構成되었으며, 예상되는 분자량은 20 kd와 52 kd이었다.
4. ORF3는 hexon-associated pIX유전자로 추정되며 내부에 1개의 polyadenylation signal(ATAAA)이 1938-1942 uncleotide에 위치하였으며, 이 부위는 TATA box (1937-1942 uncleotide)와 중복되어 존재하였다.
Porcine adenovirus type 3 (PAV-3) does not cause severe infection in pigs. Adenovirus has been suggestive of live vaccine vector carrying foreign gene. One of insertion regions is delayed early (EIB) region. However, EIB region of PAV-3 has not been molecularly characterized to date. Nucleotide sequence of EIB of PAV-3 was determined. The EIB region was composed of 1,984 bp and located between 4.0 and 9.7 map units. Three potential open reading frames(ORFs) with low level of homology to other adenoviruses and a polyadenylation signal were identified in the rightward direction of genome. The nucleotide and the predicted amino acid sequences of EIB were compared to those of human and animal adenoviruses. One of the three potential ORFs. ORF1 encoded a polypeptide homologous to bovine adenovirus type 2(BAV-2) ORF2 and human adenovirus type 41(Ad41) 19 kd protein. ORF2 encoded a polypeptide homologous to human adenovirus type 2(Ad2) 55 kd protein, bovine adenovirus type 3(BAV-3) ORF3 and porcine adenovirus type 4(PAV-4) ORF2. The predicted protein of ORF1 had homology to those of Ad41 and BAV-2 with 32 and 31% respectively, whereas the deduced protein of ORF2 had homology to those of Ad2. BAV-3 and PAV-4 with 34, 33 and 29%, respectively.
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