KCI등재
SCOPUS
Genome-Wide Association Study for Flowering Time in Korean Cowpea Germplasm
저자
서은주 (Department of Applied Plant Science, Chonnam National University) ; 김기풍 (부산대학교) ; Ryulyi Kang (Chonnam National University, Korea) ; 김규태 (Department of Applied Plant Science, Chonnam National University) ; 박아론 (전남대학교) ; 김운지 (Department of Applied Plant Science, Chonnam National University) ; 선호근 (부산대학교) ; 하보근 (Department of Applied Plant Science, Chonnam National University)
발행기관
학술지명
Plant Breeding and Biotechnology(Plant Breeding and Biotechnology)
권호사항
발행연도
2020
작성언어
English
주제어
등재정보
KCI등재,SCOPUS
자료형태
학술저널
수록면
413-425(13쪽)
KCI 피인용횟수
0
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제공처
Cowpea is an annual legume crop; although it is an essential food in developing countries, cowpea is now grownworldwide. For the genetic improvement of plants, flowering time is one of the major selection criteria. In general, flowering isregulated by photoperiod and temperature, along with the interaction between environmental factors. In this study, we aimed toinvestigate the candidate genes associated with flowering time using genome-wide association study (GWAS). To investigate theflowering time-related genes, 384 cowpea germplasms were genotyped with 51,128 single nucleotide polymorphisms (SNPs). Themain genetic component of days to flowering (DTF) was analyzed using genome association and prediction integrated tool (GAPIT)and elastic-net analyses. From the GAPIT and elastic-net analyses, a total of 23 SNPs were significantly associated with DTF amongfive (chr. 2, 3, 7, 9, and 11) and seven different chromosomes (chr. 1, 2, 3, 4, 5, 8, and 9), respectively. Based on our analysis,Vigun01g084000, Vigun01g227200, Vigun02g062600, and Vigun03g296800 were considered the major candidate genes that weresignificantly associated with DTF in cowpea. These results confirmed that DTF might be controlled by multiple genes affecting earlyflowering, delaying flowering time, repressing the transition to flowering, etc. This study will potentially contribute to effective DTFgenomic selection in plant breeding to better understand the genetic basis and explore the mechanism of flowering time.
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연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
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2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (계속평가) | KCI등재 |
2013-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.44 | 0.44 | 0.35 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0 | 0 | 0.667 | 0.13 |
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