KCI등재
SCOPUS
SCIE
Genetic diversity and population structure of the endangered fish Pseudobagrus brevicorpus (Bagridae) using a newly developed 12-microsatellite marker
저자
Yeong Ho Kwak (Soonchunhyang University) ; Kang Rae Kim (Soonchunhyang University) ; Moo Sang Kim (Digital Omics) ; In Chul Bang (Soonchunhyang University)
발행기관
학술지명
권호사항
발행연도
2020
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English
주제어
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KCI등재,SCOPUS,SCIE
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학술저널
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1291-1298(8쪽)
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Background Pseudobagrus brevicorpus is an endangered species in Korea. The development of genetic markers and geneticinformation regarding the populations of this species are needed to establish conservation strategies.
Objective As part of the conservation of P. brevicorpus, a 12-microsatellite marker was developed using next-generationsequencing (NGS) to provide current genetic population information.
Methods Microsatellites from P. brevicorpus were identified by NGS analysis. Genetic diversity and genetic structureanalysis of six populations (Seojeong Stream [SJ], Gokgang Stream [GK], Jaho Stream [JH], Daega Stream [DG], NamRiver [NG], and Deokcheon River [DC]) of P. brevicorpus were conducted using the newly developed microsatellite marker.
Results NGS generated 10,347,578 reads and identified 659,507 simple sequence repeats. Twelve microsatellites were successfullyamplified and verified in 30 individuals of P. brevicorpus. The genetic diversity of the six P. brevicorpus populationsin terms of the number of alleles ranged from 3.667 to 7.111. All populations except DG deviated significantly fromHardy–Weinberg equilibrium (HWE) at one or more loci. The genetic distances of the six populations showed the closestrelationship between the SJ and GK populations (independent Stream populations), and there was a close relationship withthe JH population among the Nakdong River. Structure analysis showed that P. brevicorpus is largely divided into two groups.
Conclusions The developed microsatellite marker will be used to provide basic genetic data of P. brevicorpus. Genetic diversityand structure analysis of the population will provide useful information for conservation management of P. brevicorpus
분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2015-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2012-05-07 | 학술지명변경 | 한글명 : 한국유전학회지 -> Genes & Genomics | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2008-04-14 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Genetics -> Genes and Genomics | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재학술지 선정 (등재후보2차) | KCI등재 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 유지 (등재후보1차) | KCI후보 |
1999-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.51 | 0.12 | 0.38 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.32 | 0.27 | 0.258 | 0.02 |
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