KCI등재
Null Allele in the D18S51 Locus Responsible for False Homozygosities and Discrepancies in Forensic STR Analysis
저자
발행기관
대한의생명과학회(The Korean Society For Biomedical Laboratory Sciences)
학술지명
권호사항
발행연도
2011
작성언어
English
주제어
KDC
510
등재정보
KCI등재
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
151-155(5쪽)
제공처
소장기관
Short tandem repeats (STRs) loci are the genetic markers used for forensic human identity test. With multiplex polymerase chain reaction (PCR) assays, STRs are examined and measured PCR product length relative to sequenced allelic ladders. In the repeat region and the flanking region of the commonly-used STR may have DNA sequence variation. A mismatch due to sequence variation in the DNA template may cause allele drop-out (i.e., a “null” or “silent” allele) when it falls within PCR primer binding sites. The STR markers were co-amplified in a single reaction by using commercial PowerPlex<SUP>?</SUP> 16 system and AmpFlSTR<SUP>?</SUP> Identifiler<SUP>?</SUP> PCR amplification kits. Separation of the PCR products and fluorescence detection were performed by ABI PRISM<SUP>?</SUP> 3100 Genetic Analyzer with capillary electrophoresis. The GeneMapperTM ID software were used for size calling and analysis of STR profiles. Here, this study described a forensic human identity test in which allelic drop-out occurred in the STR system D18S51. During the course of human identity test, two samples with a homozygous (16, 16 and 21, 21) null genotype at D18S51 locus were discovered using the PowerPlex<SUP>?</SUP> 16 system. The loss of alleles was confirmed when the samples were amplified using AmpFlSTR<SUP>?</SUP> Identifiler<SUP>?</SUP> PCR amplification kit and resulted in a heterozygous (16, 20 and 20, 21) genotype at this locus each other. This discrepancy results suggest that appropriate measures should be taken for database comparisons and that null allele should be further investigated by sequence analysis and be reported to the forensic community.
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