KCI등재후보
SCIE
SCOPUS
분자표지 활용 무 육종을 위한 High-throughput DNA 추출법 탐색 = Efficient High-throughput DNA Extraction Protocol for Marker Assisted Selection in Radish (Raphanus sativus L.)
저자
최정근(Jeong-Keun Choi) ; 박수형(Suhyoung Park) ; 윤도원(Doh-Won Yun) ; 구자환(Ja-Hwan Ku)
발행기관
학술지명
원예과학기술지(Korean journal of horticultural science & technology)
권호사항
발행연도
2006
작성언어
Korean
주제어
KDC
525
등재정보
KCI등재후보,SCIE,SCOPUS
자료형태
학술저널
발행기관 URL
수록면
431-435(5쪽)
KCI 피인용횟수
1
제공처
소장기관
배추과 작물의 자가불화합성은 잡종종자의 생산에 유용하게 이용되어왔다. 자가불화합 특성은 주두측의 S-locus glycoprotein(SLG)와 S-locus receptor kinase(SRK)에 의하여 발현이 조절되는 것으로 보고 되었다. 이에 관련된 연구가 활발하게 진행된 결과 육종 기간과 선발에 소요되는 대면적 재배를 효과적으로 감소시킬 수 있는 다양한 분자표지들이 개발되었다. 본 연구는 유용한 분자 표지를 실질적으로 육종에 활용하고자 할 때 기본적으로 필요한 DNA의 high-throughput 추출법을 밝히고자 수행하였다. 무는 조직내부에 상당량의 polysaccharide가 함유되어 있어 DNA의 추출이 다른 작물에 비하여 까다롭다. 따라서 CTAB법을 변형시킨 다양한 방법이 활용되어 왔으나 다수의 시료에서 단기간에 DNA를 추출하기에는 어려움이 있다. 본 연구에서는 시료 마쇄에 소요되는 노력을 절감하기 위하여 시료의 마쇄 상태가 최종적인 DNA의 수율에 영향을 적게 미치는 것으로 보고된 Xanthogenate 버퍼 이용법과 시중에 판매되고 있는 Dneasy 96-plant kit 및 Wizard Magnetic 96 DNA plant system, 그리고 FB plate와 Xanthogenate 버퍼를 함께 이용하는 방법 중 무의 high-throughput DNA 추출에 효과적인 방법을 찾고자 하였다. 실험 결과 위의 4가지 DNA 추출 방법 모두 목적 DNA를 증폭시킴으로 무의 PCR based selection에는 적합한 것으로 판단되었다. 시약과 팁 등 부대소모품의 가격, 추출에 필요한 노력, DNA의 품질과 PCR 증폭 효율을 비교한 결과 FB plate와 Xanthogenate버퍼를 이용한 방법이 가장 효과적이었음을 밝혔다.
더보기The self-incompatibility (SI) has been used for hybrid seed production in Brassica crops. Concerning the SI response, the S-locus glycoprotein (SLG) and the S-locus receptor kinase (SRK) genes were reported to control the SI response in the stigmatic side. Many primers have been developed using sequence of these two specific genes in Brassica crops. The first step of applying these primers into molecular analysis of SI is DNA extraction. In order to analyse thousands of sample in a short time, finding fast and efficient DNA extraction method was required. In this study, four kinds of DNA extraction methods (xanthogenate buffer, FB plate with xanthogenate buffer, Dneasy 96-plant kit, and Wizard Magnetic 96 DNA plant system) were compared for efficiency in radish. All four PCR amplification results show target bands, thus these four methods were considered good for PCR-based selection in radish. Comparing cost, labour, DNA quality and PCR amplification rate, a method using FB plate with xanthogenate buffer was proved efficient for DNA extraction in radish.
더보기분석정보
연월일 | 이력구분 | 이력상세 | 등재구분 |
---|---|---|---|
2023 | 평가예정 | 해외DB학술지평가 신청대상 (해외등재 학술지 평가) | |
2020-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (해외등재 학술지 평가) | KCI등재 |
2017-02-08 | 학술지명변경 | 외국어명 : Korean Journal of Horticultural Science & Technology -> Horticultural Science & Technology | KCI등재 |
2011-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2009-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2007-01-01 | 평가 | 등재학술지 유지 (등재유지) | KCI등재 |
2004-01-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
2003-01-01 | 평가 | 등재후보 1차 PASS (등재후보1차) | KCI후보 |
2002-07-01 | 평가 | 등재후보학술지 선정 (신규평가) | KCI후보 |
기준연도 | WOS-KCI 통합IF(2년) | KCIF(2년) | KCIF(3년) |
---|---|---|---|
2016 | 0.92 | 0.74 | 0.83 |
KCIF(4년) | KCIF(5년) | 중심성지수(3년) | 즉시성지수 |
0.77 | 0.73 | 1.115 | 0.19 |
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