What does it mean to identify proteins from 2-DE in proteomics? = 단백질체학에서 이차원전기영동을 이용해 단백질을 동정하는 것은 무엇을 의미하는가?
사람을 비롯한 많은 생물체의 유전체가 밝혀졌거나 밝혀지고 있는 가운데 우리의 관심은 유전자의 기능쪽으로 향하고 있다. 그동안 유전자의 기능을 알아내기 위한 주요 연구 방법은 유전체학을 이용한 것이었다. 그러나, 유전체 수준에서의 접근방법은 유전자의 기능을 구체적으로 밝히는데 많은 어려움을 갖고 있다. 따라서, 단백질 수준에서 유전체의 기능을 밝히는 단백질체학이 최근 몇 년간 비약적인 증가를 보이고 있다. 이 분야의 분석 기술은 이차원 젤 전기영동을 통한 display 기술과 질량 분석을 통한 극미량 동정 기술이 접목되어 현재 가장 널리 사용되고 있는 기술이다. 프로테옴은 항상 변화하고 있는 역동적인 상태에 있기 때문에 유전체에 비해 훨씬 복잡하다. 더욱이 실제 기능을 수행하는 단백질이 되기까지 다양한 형태의 modification을 유전자 수준에서는 예측이 불가능함으로 이차원 전기영동 기술이 필요한 것이다. 이는 가로 세로 각각 200㎜의 젤을 만들어 수 십에서 수 백㎍의 단백질을 걸고 silver staning하여 1000~3000개의 단백질 스팟을 검출하는 것이다. 단백질의 종류가 적어도 일이십만개라고 할 때, 젤로 찾아낼 수 있는 단백질의 스팟은 프로테옴 전체의 작은 부분에 지나지 않는 한계가 있어도 이차원 전기영동을 이용한 단백질의 검출과 동정은 유전체의 기능을 밝히는데 매우 효과적인 접근 방법이다. 질병에 대한 프로테옴의 연구 목표는 질병의 조기진단, 예후판정, 및 치료법 선택등을 위한 biomarker를 개발하고, 신약개발의 타겟을 찾는 것이다. 더욱이 각 종 단백질체학간의 상호보완을 통한 연구는 생명과학의 궁극적인 목표인 생명체를 분자적 수준에서 이해하는데 보다 구체적이고 명확한 개념을 제공할 수 있을 것이다.
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